07:48 Синдекан 1 | |
| [править | править вики-текст] Материал из Википедии — свободной энциклопедии Перейти к: навигация, поиск Синдекан 1 Доступные структуры PDB Поиск ортологов: PDBe, RCSB [показать]Список идентификаторов PDB 4GVC, 4GVD Идентификаторы Символ SDC1 ; CD138; SDC; SYND1; syndecan Внешние ID OMIM: 186355 MGI: 1349162 HomoloGene: 2252 GeneCards: SDC1 Gene [показать]Генная онтология Функция • glycoprotein binding • protein binding • protein C-terminus binding • cytoskeletal protein binding Компонент клетки • cytoplasm • Golgi lumen • plasma membrane • integral component of plasma membrane • focal adhesion • external side of plasma membrane • lysosomal lumen • protein complex • extracellular vesicular exosome Биологический процесс • retinoid metabolic process • ureteric bud development • carbohydrate metabolic process • glycosaminoglycan biosynthetic process • glycosaminoglycan catabolic process • inflammatory response • phototransduction, visible light • response to toxic substance • extracellular matrix organization • glycosaminoglycan metabolic process • chondroitin sulfate metabolic process • wound healing • lipoprotein metabolic process • odontogenesis • response to hydrogen peroxide • small molecule metabolic process • myoblast development • response to glucocorticoid • response to cAMP • response to calcium ion • striated muscle cell development • Sertoli cell development • canonical Wnt signaling pathway Источники: Amigo / QuickGO Профиль экспрессии РНК Больше информации Ортологи Вид Человек Мышь Entrez 6382 20969 Ensembl ENSG00000115884 ENSMUSG00000020592 UniProt P18827 P18828 RefSeq (мРНК) NM_001006946 NM_011519 RefSeq (белок) NP_001006947 NP_035649 Локус (UCSC) Chr 2: 20.4 – 20.43 Mb Chr 12: 8.77 – 8.79 Mb Поиск в PubMed [1] [2] Шаблон: просмотр • обсуждение • править Синдекан 1 (англ. syndecan 1; CD138) — мембранный белок, протеогликан семейства синдеканов, или трансмембранных гепарансульфатпротеогликанов. Всего описано 4 белка этого семейства. Продукт гена человека SDC1. Содержание [скрыть] 1 Функции 2 Структура 3 Применение 4 См. также 5 Примечания 6 Литература 7 Ссылки Функции[править | править вики-текст] Белок является трансмембранным гепарансульфатпротеогликаном, входит в семейство синдеканов. Синдеканы опосредуют связывание клеток, передачу сигнала в клетке и организацию цитоскелета. Являются рецепторами для Tat-белка вируса ВИЧ. Синдекан 1 участвует в клеточной пролиферации, клеточной миграции и клеточном взаимодействии с белками внеклеточного матрикса.[1] Структура[править | править вики-текст] Синдекан 1 несёт гепарансульфатные и хондроитинсульфатные цепи, которые обеспечивают связь цитоскелета с внеклеточным матриксом. Связывается с CDCP1. Отщепление эктодомена приводит к образованию растворимой формы белка. Отщепление может происходить под действием гепараназы, тромбина и эпидермального фактора роста, а также при стрессе и в процессе заживления раны. Белок состоит из 288 аминокислот, молекулярная масса белковой части — 32.5 кДа. Включает N-концевой внеклеточный домен (232 аминокислоты), единственный спиральный трансмембранный фрагмент и небольшой цитозольный участок. На внеклеточном домене находится 6 участков гликозилирования: 3 участка присоединения O-хондроитинсульфатных цепей, 2 участка присоединения O-гепарансульфатных цепей и 1 участок N-гликозилирования. Цитозольный фрагмент содержит фосфорилируемый тирозин. Применение[править | править вики-текст] Синдекан 1 используется в качестве маркёра плазматических клеток[2], если известно, что клетки произошли из клеток крови.[3] См. также[править | править вики-текст] Синдеканы Синдекан 2 Примечания[править | править вики-текст] ↑ Entrez Gene: SDC1 syndecan 1. ↑ Rawstron AC (May 2006). «Immunophenotyping of plasma cells». Curr Protoc Cytom Chapter 6: Unit6.23. DOI:10.1002/0471142956.cy0623s36. PMID 18770841. ↑ O'Connell FP, Pinkus JL, Pinkus GS (February 2004). «CD138 (syndecan-1), a plasma cell marker immunohistochemical profile in hematopoietic and nonhematopoietic neoplasms». Am. J. Clin. Pathol. 121 (2): 254–63. DOI:10.1309/617D-WB5G-NFWX-HW4L. PMID 14983940. Литература[править | править вики-текст] Teng YH, Aquino RS, Park PW (January 2012). «Molecular functions of syndecan-1 in disease». Matrix Biol. 31 (1): 3–16. DOI:10.1016/j.matbio.2011.10.001. PMID 22033227. Katz BZ (June 2010). «Adhesion molecules--The lifelines of multiple myeloma cells». Semin. Cancer Biol. 20 (3): 186–95. DOI:10.1016/j.semcancer.2010.04.003. PMID 20416379. Bass MD, Morgan MR, Humphries MJ (March 2009). «Syndecans shed their reputation as inert molecules». Sci Signal 2 (64): pe18. DOI:10.1126/scisignal.264pe18. PMID 19336838. Ссылки[править | править вики-текст] Клеточный матрикс. Синдекан. [скрыть] Белки: Кластеры дифференцировки 1-50 CD1 (a-c, 1A, 1D, 1E) · CD2 · CD3 (γ, δ, ε) · CD4 · CD5 · CD6 · CD7 · CD8 (a) · CD9 · CD10 · CD11 (a, b, c, d) · CD13 · CD14 · CD15 · CD16 (A,  · CD18 · CD19 · CD20 · CD21 · CD22 · CD23 · CD24 · CD25 · CD26 · CD27 · CD28 · CD29 · CD30 · CD31 · CD32 (A, · CD33 · CD34 · CD35 · CD36 · CD37 · CD38 · CD39 · CD40 · CD41 · CD42 (a, b, c, d) · CD43 · CD44 · CD45 · CD46 · CD47 · CD48 · CD49 (a, b, c, d, e, f) · CD50 51-100 CD51 · CD52 · CD53 · CD54 · CD55 · CD56 · CD57 · CD58 · CD59 · CD61 · CD62 (E, L, P) · CD63 · CD64 (A, B, C) · CD66 (a, b, c, d, e, f) · CD68 · CD69 · CD70 · CD71 · CD72 · CD73 · CD74 · CD78 · CD79 (a, b) · CD80 · CD81 · CD82 · CD83 · CD84 · CD85 (a, d, e, h, j, k) · CD86 · CD87 · CD88 · CD89 · CD90 · CD91 · CD92 · CD93 · CD94 · CD95 · CD96 · CD97 · CD98 · CD99 · CD100 101-150 CD101 · CD102 · CD103 · CD104 · CD105 · CD106 · CD107 (a, b) · CD108 · CD109 · CD110 · CD111 · CD112 · CD113 · CD114 · CD115 · CD116 · CD117 · CD118 · CD119 · CD120 (a, b) · CD121 (a, b) · CD122 · CD123 · CD124 · CD125 · CD126 · CD127 · CD129 · CD130 · CD131 · CD132 · CD133 · CD134 · CD135 · CD136 · CD137 · CD138 · CD140b · CD141 · CD142 · CD143 · CD144 · CD146 · CD147 · CD148 · CD150 151-200 CD151 · CD152 · CD153 · CD154 · CD155 · CD156 (a, b, c) · CD157 · CD158 (a, d, e, i, k) · CD159 (a, c) · CD160 · CD161 · CD162 · CD163 · CD164 · CD166 · CD167 (a, b) · CD168 · CD169 · CD170 · CD171 · CD172 (a, b, g) · CD174 · CD177 · CD178 · CD179 (a, b) · CD181 · CD182 · CD183 · CD184 · CD185 · CD186 · CD191 · CD192 · CD193 · CD194 · CD195 · CD196 · CD197 · CDw198 · CDw199 · CD200 201-250 CD201 · CD202b · CD204 · CD205 · CD206 · CD207 · CD208 · CD209 · CDw210 (a, b) · CD212 · CD213a (1, 2) · CD217 · CD218 (a, b) · CD220 · CD221 · CD222 · CD223 · CD224 · CD225 · CD226 · CD227 · CD228 · CD229 · CD230 · CD233 · CD234 · CD235 (a, b) · CD236 · CD238 · CD239 · CD240CE · CD240D · CD241 · CD243 · CD244 · CD246 · CD247 · CD248 · CD249 251-300 CD252 · CD253 · CD254 · CD256 · CD257 · CD258 · CD261 · CD262 · CD263 · CD264 · CD265 · CD266 · CD267 · CD268 · CD269 · CD270 · CD271 · CD272 · CD273 · CD274 · CD275 · CD276 · CD278 · CD279 · CD280 · CD281 · CD282 · CD283 · CD284 · CD286 · CD288 · CD289 · CD290 · CD292 · CDw293 · CD294 · CD295 · CD297 · CD298 · CD299 301-350 CD300A (англ.)русск. · CD301 · CD302 · CD303 · CD304 · CD305 · CD306 · CD307 · CD309 · CD312 · CD314 · CD315 · CD316 · CD317 · CD318 · CD320 · CD321 · CD322 · CD324 · CD325 · CD326 · CD328 · CD329 · CD331 · CD332 · CD333 · CD334 · CD335 · CD336 · CD337 · CD338 · CD339 · CD340 · CD344 · CD349 · CD350 351-363 CD351 · CD352 · CD353 · CD354 · CD355 · CD357 · CD358 · CD360 · CD361 · CD362 · CD363 Источник — «https://ru.wikipedia.org/w/index.php?title=Синдекан_1&oldid=74609917» Категории: Белки по алфавитуБелки человекаМембранные белкиКластеры дифференцировкиСкрытая категория: Страницы, использующие волшебные ссылки PMID | |
|
| |
| Всего комментариев: 0 | |